Минно-торпедный факультет начал подготовку специалистов в училище подводного плавания 29 сентября 1952 года. Впоследствии он назывался противолодочного вооружения, а в настоящее время факультет носит название противолодочного, торпедного и минного вооружения подводных лодок. Первым начальником факультета был назначен капитан 1 ранга Д.Г. Кладов. В разные годы факультетом командовали офицеры, проходившие службу на соединениях подводных лодок и имеющие большой опыт подготовки и воспитания специалистов. Это капитаны 1 ранга Герой Советского Союза В.Г. Стариков, М.Г. Проскунов, В.И. Иевлев, О.И. Костин, В.П. Кулибаба, Герой Советского Союза Л.Р. Куверский, А.И. Соленков. И сейчас его возглавляют опытные офицеры и воспитатели – начальник  факультета капитан 1 ранга С.И. Завалин и его заместитель капитан 1 ранга И.Н. Гунька.    
Вместе с созданием факультета были сформированы три специальные кафедры: торпедного оружия (начальник кафедры Д.Ф. Тиханюк); минно-трального оружия и средств ПЛО (начальник кафедры В.С. Сюртуков) и кафедра боевого использования торпедного оружия (начальник кафедры Л.Я. Лонцих). Позднее две первые кафедры были объединены в одну - противолодочного и минно-торпедного вооружения подводных лодок.

К концу 1952 года на специальных кафедрах факультета начали функционировать три лаборатории: боевого применения торпедного оружия; минно-трального оружия и лаборатория противолодочного оружия. Большую работу по созданию и оборудованию лабораторий выполнили мичманы В.Г. Аристов, С.Я. Барышев, Я.Е. Минин, М.П. Зоркин,  М.А. Климов, Б.К. Копылов, С.К. Кузнецов, И.М. Намятов, Л.Х. Николайчук, В.В. Щуров, В.П. Подлубенко, Г.В. Пужаев, П.В. Спасков, П.Г. Шилов,  А.В. Подставничев.
Минно-торпедный факультет всегда по праву гордился своими преподавателями. С огромным интересом на специальных кафедрах проходили занятия под руководством командира БЧ-2-3 гвардейской подводной лодки «Л-3» И.А. Дубинского и командира БЧ-2-3 Краснознаменной подводной лодки «С-51» М.К. Свиридова. Позже на кафедре Торпедного оружия преподавали командир БЧ-2-3 подводной лодки «С-13» К.Е. Василенко, а на кафедре Боевого применения известный подводник Герой Советского Союза капитан 1 ранга М.С. Калинин.

В 1960 году из Высшего Военно-морского училища инженеров оружия в училище Подводного Плавания были переведены ведущие преподаватели специальных дисциплин: Б.Ф. Майоров, Е.П. Тимофеев и Д.Д. Шугайло. Огромную роль в развитии минно-торпедного факультета сыграл приход в училище лауреата Государственной премии, выдающегося ученого, педагога и изобретателя профессора А.Б. Гейро. С его именем связан период бурного роста научного потенциала факультета и развития технической оснащенности специальных кафедр, особенно кафедры Минного оружия.    
К концу 1961 года был завершен переход училища на командно-инженерный профиль. Подготовка специалистов с высшим образованием  потребовала создания новых курсов учебных дисциплин. В создании курса дисциплины «Торпедное оружие» огромную работу проделали Д.Д. Шугайло, Г.Ф. Масалов, П.Д. Сошенко, А.П. Усов, К.И. Маргарянц. Курс «Торпедные аппараты» разработали А.Н. Касьянов и А.А. Холупко. Дисциплину «Ракетное противолодочное оружие создали» А.П. Милошенко и А.А. Вазин. Курс дисциплины «Электромеханические и цифровые специализированные системы управления» разработали Л.В. Егоренко, В.М. Булкин и Б.Ф. Майоров. Дисциплину «Минное оружие» создали  А.Б. Гейро, А.Г. Агафонов, В.В. Красников, А.А. Молчанов и А.В. Сазонов. Курс дисциплины «Боевое применение торпедного оружия» успешно разработали и преподавали  Л.Я. Лонцих, М.К. Свиридов,  В.В. Архангельский, А.В. Стоянов, Е.Р. Макрицкий, Н.А. Никаншин, Б Ю. Громов, Л.С. Лисин.
Период 60-70-х годов  можно охарактеризовать как годы становления и интенсивного развития минно-торпедного факультета. В это время на специальных кафедрах были созданы учебные кабинеты: приборов управления движением торпед; торпедной стрельбы; ракетного противолодочного оружия; торпедных аппаратов и кабинет минного оружия. Пополнились новыми образцами оружия и вооружения и тренажерной техники лаборатории кафедр. Благодаря усилиям таких начальников кафедр, как А.Б. Гейро, Д.Д. Шугайло, Л.С. Лисина, М.К. Свиридова, А.Г. Агафонова, В.В. Красникова, А.П.Усова, А.А. Вазина, Н.И. Будкина, К.С. Семёнова и других, новейшие образцы оружия и военной техники своевременно поступали в лаборатории кафедр для обеспечения полноценной подготовки специалистов на самой современной технике. Иногда, даже сразу, после заводских и государственных испытаний.

 

Большую работу по оборудованию монтажу и подготовке лабораторной базы выполнил мичманский состав кафедр. Руками таких специалистов, как мичманы В.П. Бахвалов, В.А. Брагин, А.М. Глазырин, Г.Н. Голынский, А.А. Зубарев, М.А. Климов, В.В. Цапаев, Н.И. Подольский, Ю.И. Иванов, В.В. Чекаев, А.Ф. Галимов, А.Б.Саха, А.М. Сляднев, Ю.Д Апанасенко, М.И. Булдин, В.А. Попович, В.Н. Федоркин, Н.М. Соколов, П.В. Пехтелев,  П.А. Зелинский, Б.И Степанов и других были созданы уникальные тренажеры и учебно-действующие модели, позволяющие качественно проводить практическую подготовку будущих офицеров. В настоящее время под руководством начальников лабораторий Н.А. Карасева и М.Н. Будкина, а также инструкторов  В.А. Горячева, С.В. Николаева, Ю.Д. Апанасенко и М.А. Крошнина вся  учебно-материальная база поддерживается  в надлежащем состоянии. Большой вклад в организацию делопроизводства кафедр и факультета внесли служащие Э.А. Немирова, Т.А. Кучмасова, Н.И. Олейникова, И.Г. Степанова, Г.И. Павлинова, А.А. Дулатова, С.А. Фрунташ.

В разные годы  на специальные кафедры факультета пришли командиры подводных лодок, флагманские специалисты, командиры минно-торпедных боевых частей. С их приходом процесс обучения становился более динамичным и в значительной степени  приближенным к практической деятельности флота. По праву заслуженным авторитетом среди курсантов пользовались и пользуются такие  преподаватели как: А.Б. Гейро, М.К.Свиридов, Н.А. Никаншин, А.В. Стоянов, А.В. Кузьмин, Б.Ф. Майоров, А.Г. Сычев, А.В. Егоренко, А.И. Байков, А.Н. Катилов, В.В. Красников, А.Г. Агафонов, Л.С. Лисин, В.М. Булкин,  Б Ю. Громов, А.В.Сазонов, И.М.Щелоков, Ю.Л. Пивоваров, В.В. Рогальский, Г.П. Карасев, А.Н. Касьянов, П.Д. Сошенко, Г.Ф. Масалов, В.И. Лебедев, К.И. Маргарянц, В.С. Федоров, В.П. Данилов, А.И. Калиновский, И.А Лиходиевский, А.А. Вазин, К.С. Семенов, А.П. Усов, А.А. Воробьев, Ю.А. Богданов, В.Н. Папушин, Д.С. Иванов, Н.М. Серогодский, Б.Ф. Чернавин, А.В. Семенов, Е.А. Крутофалов, Ю.С. Окишев, Н.И. Будкин, В.Г. Баранов, В.К. Васильчиков, М.В. Соколов, В.Г. Кочанов, А В Пивовар, Ю.В. Трофимов, А.И. Балакшин, А.Н. Животов, С.Ф. Мороз, Д.В. Чубаров, А.Г. Клечкин.

Минно-торпедный факультет всегда считался и считается одним из передовых в подготовке научных кадров. За время существования специальных кафедр 38 человек защитили кандидатские диссертации, 6 человек (А.Б. Гейро, В.В. Красников, А.П. Усов,  В.С.Федоров,   А.А. Вазин, К.С. Семенов) стали профессорами. Всего  профессорско-преподавательским составом  специальных кафедр  было написано   15 учебников и более 250 учебных  и учебно-методических пособий. Созданы новые методики по подготовке,  безаварийной эксплуатации и хранению торпедного, ракетного противолодочного и минного оружия. Разработаны новые, более эффективные способы торпедной стрельбы. Выработаны, апробированы и внедрены адаптированные к современным условиям  алгоритмы действий корабельных боевых расчетов. Все эти научные, методические и технические разработки нашли широкое применение, как в учебном процессе при подготовке будущих специалистов, так и на действующем флоте.
Командование факультета всегда уделяло и уделяет большое внимание учебно-воспитательному процессу. Большая роль в формировании  и воспитании будущих офицеров лежит на командирах рот, от которых на прямую зависит не только организация и дисциплина, но и успеваемость будущих выпускников. В разные годы ротами факультета командовали: Л.Н. Калобашкин,  В.Н. Вахрушев, А.Е. Антипин, И.Н. Дуркин, М.Н. Колодь, Н.А. Долотов, М.М. Каширин, В.А. Тарченко, Н.И. Циндренко, П.Д. Сошенко, А.А. Вазин, И.П. Черняк, Н.В. Рузанов, И.Н. Качин, А.А. Сапегин, Г.Ф. Муратов, В.И Глущенко, А.М. Мартыненко, К.С. Семенов, В.М. Кизев, С.Л. Агеев, И.Н. Гунька, И.П. Дмитриев, А.Н. Животов, В.И. Киселев, С.А. Корнеев, О.Б. Молчанов, А.А. Павлов, Е.В. Семенов, М.В. Сухарев, Д.В. Чубаров, А.Ю. Мишин, А.А. Гурьев, А.С. Иванов, М.В. Петров, А.В. Орехов, А.В. Востриков, Е.Н. Политаев.
За 55 лет своего существования минно-торпедный факультет выпустил более 4137 офицеров. 57 выпускников окончили училище с золотой медалью, а 334 человека с отличием. Каждый третий выпускник факультета стал командиром подводной лодки. Более 30 человек стали адмиралами. Семь выпускников удостоены высокого звания Героя Советского Союза, а два выпускника удостоены звания Героя Российской Федерации. В настоящее время выпускающие кафедры факультета укомплектованы высоко квалифицированными научно-педагогическими кадрами, профессорско-преподавательским  и мичманским составом.
Обучением и воспитанием будущих специалистов торпедного удара, на кафедре боевого применения противолодочного и минно-торпедного вооружения подводных лодок под руководством заслуженного военного специалиста, почетного работника высшего профессионального образования, кандидата военных наук, профессора капитана 1 ранга Семенова К.С. занимаются: заслуженные работники высшего образования кандидаты военных наук доцент капитан 1 ранга в отставке В.М.Булкин и профессор капитан1 ранга в запасе В.С. Федоров; капитан 1 ранга в запасе Ю.С. Окишев; капитаны 2 ранга доцент А.В. Макурин и А.Г. Клечкин; старший лейтенант М.Н. Будкин; старший мичман В.А. Горячев и мичман М.А. Крошнин.

На кафедре противолодочного и минно-торпедного вооружения подводных лодок под руководством доцента капитана 1 ранга А.И. Балакшина обучением будущих офицеров минно-торпедной специальности занимаются: профессоры капитаны 1 ранга в отставке А.П. Усов и А.А. Вазин; почетные работники высшего профессионального образования капитаны 1 ранга в запасе доцент Н.И. Будкин и Н.М. Серогодский; капитан 2 ранга в запасе Ю.В. Трофимов; капитаны 2 ранга А.Н. Животов и Д.В. Чубаров; капитан 3 ранга Н.А. Карасёв; старший мичман С.В.Николаев; старший мичман в запасе Ю.Д. Апанасенко и служащая С.А. Фрунташ.
На сегодняшний день факультет противолодочного, торпедного и минного вооружения подводных лодок является одним из ведущих факультетов института.  Специальные кафедры факультета по праву считаются передовыми. Подтверждением тому является присвоение приказом Главнокомандующего ВМФ № 489 от 22.12.02 г. за достигнутые успехи в подготовке квалифицированных кадров лаборатории минного оружия почетного наименования «Учебная лаборатория имени профессора А.Б. Гейро».