Новый этап в развитии радиоэлектронного вооружения ВМФ наступил в 1950-1960 годах, когда на флот в больших количествах стали поступать корабли новых проектов, оснащенные новыми видами РЭС.
Именно тогда на основании Приказа МО СССР от 04.01.1956 года, директивы ГК ВМФ от 14.03.1956 года сформирован 5-й отдел Ленинградского военно-морского района. Таким образом, история нынешнего Радиотехнического отдела ЛенВМБ начала отсчет с 14 марта 1956 года.
На момент основания 5-го отдела Ленинградского ВМР в его состав входили: береговой информационный пост, склад радиотехнического вооружения, дислоцированные в городе Ленинграде. Первыми начальниками 5-го отдела ЛенВМР являлись капитан 2 ранга Гречишников Василий Владимирович (1956-1958 гг.), капитан 1 ранга Кожарин Владимир Иванович (1958-1962 гг.).
В 1960 году 5-й отдел ЛенВМР становится 5-м отделом ЛенВМБ. Территориально он располагался на острове Новая Голландия, по соседству с тылом ЛенВМБ, поэтому в 1962 году согласно директивы ГШ ВМФ командир ЛенВМБ приказал подчинить 5-й отдел базы своему заместителю по тылу - начальнику тыла ЛенВМБ. К этому времени в состав 5-го отдела вошел склад РТИ и радиотехническая мастерская в г. Кронштадте, впоследствии объединенные в одну структуру склада РТВ.
С 1962 по 1972 год 5-м отделом командовал капитан 1 ранга Ляшко Владимир Яковлевич. С 1 апреля 1969 года была сформирована и вошла в состав частей, подчиненных 5-му отделу, радиотехническая ремонтная мастерская.
В 1970 году 5-й отдел в соответствии с приказом командира ЛенВМБ был выведен из состава тыла базы и подчинен начальнику штаба ЛенВМБ. Также с 1970 года начальнику 5-го отдела директивой штаба ЛенВМБ была подчинена  отдельная радиотехническая рота (г. Кронштадт) в составе: поста НиС (г. Приморск), РТП (п. Шепелево),  РТП (м. Стирсудден), РТП (о. Гогланд), РТП (д. Горки), РТП (о. Мощный). Подразделения береговой системы наблюдения за прошедшие 36 лет неоднократно переформировывались. Так, в 1972 году подразделение на о. Мощный преобразовано в  морской РТВ, на м. Стирсудден - в мртв, на о.Гогланд - в  мртв, в г. Приморске - в мртв, в п. Шепелево - в мртв, в д. Горки - в  мртв.
С 1972 года командование 5-м отделом принял капитан 1 ранга Каргин Сергей Михайлович, руководивший им до 1979 года. С 1979 по 1982 гг. командовал 5-м отделом ЛенВМБ капитан 1 ранга-инженер Кочерга Станислав Данилович.
Следует отметить, что вместе с развитием радиоэлектроники расширялся круг задач, решаемых 5-м отделом, увеличивалось количество подчиненных частей и подразделений, повышалось боевое мастерство специалистов радиотехнической службы. В 1982 году командование 5-м отделом принял капитан 1 ранга Тритенко Николай Дмитриевич. В 1986 году директивой ГШ ВМФ 5-й отдел ЛенВМБ преобразован в Радиотехнический отдел ЛенВМБ. Таким образом, с 30 июля 1986 года должность начальника 5-го отдела стала именоваться, как и в настоящее время, - начальник РТО - начальник РТС ЛенВМБ.
В 1989 году в командование Радиотехническим отделом и РТС ЛенВМБ вступил капитан 1 ранга Македонский Виктор Маркович, в 1995 году передавший руководство капитану 1 ранга Фролову Александру Дмитриевичу.
Радиоэлектронная техника продолжала развиваться, расширялись возможности радиоэлектронных средств- радиолокационных и гидроакустических комплексов.
РТС ЛенВМБ к этому времени представляла крупный боевой организм, решающий сложные задачи наблюдения за морской обстановкой в зоне ответственности ЛенВМБ и инженерно-радиоэлектронного обеспечения сил базы.
В 1991 году на базе отдельной радиотехнической роты был сформирован район наблюдения
(г. Кронштадт) в составе радиотехнических подразделений. За достаточно короткий по историческим меркам период времени структура района наблюдения неоднократно изменялась, что связано с проводившимся реформированием как ВМФ, так и Вооруженных Сил РФ в целом. Сейчас, как и прежде, в состав частей, подчиненных радиотехническому отделу ЛенВМБ, входят район наблюдения, склад РТВ, радиотехническая ремонтная мастерская и береговой информационный пост. В разное время в подчиненных отделу частях служили офицеры радиотехнической службы, настоящие профессионалы, многие из которых - ветераны флота. Хочется отметить большой труд, проделанный бывшими командирами подчиненных частей: района наблюдения - Лоскута И.И., Близнюка В.А., Комарина В.Н.; складом РТВ - Шепелева Е.Д., Житника В.П.; радиотехнической ремонтной мастерской - Хиврича С.Ф.; БИП - Степина В.И., Чумаченко А.Г., Филиппова А.В.
В настоящее время поддержание всех радиоэлектронных средств кораблей и береговых частей ВМФ в постоянной технической исправности и высокой боевой готовности является долгом каждого специалиста РТС. Понимая это, большую ответственную работу проводят нынешние командиры подчиненных радиотехническому отделу частей и подразделений: капитан 2 ранга   Дручек Ю.А., капитан 2 ранга Левченко А.В., капитан 3 ранга Бобриков Н.В., капитан-лейтенант Белошейкин С.И., капитан-лейтенант Данюк В.П., капитан-лейтенант Сухов В.А.
Большие ответственные задачи возложены на специалистов, работающих в РТО ЛенВМБ - органе военного управления базы. Это ремонт, снабжение, вооружение радиоэлектронными средствами кораблей и береговых частей ЛенВМБ, а также частей центрального подчинения, стоящих на довольствии в Радиотехническом отделе. От слаженности и четкости работы, высоких компетенции и профессионализма специалистов РТО ЛенВМБ в немалой степени зависит боевая готовность соединений и частей базы. Сегодня хочется отметить хорошую работу офицеров отдела капитана 2 ранга Алексеева Д.Н., капитана 3 ранга Гайдукевича Ю.А., капитана 3 ранга Кутумова К.Б., инженеров отдела - ветеранов ВМФ Оконешникова А.Е., Носко А.А., Шевченко И.П., а также служащих Михайлову И.Н., Шашерину Н.Л., Ухову Л.С.
В заключение хочу поздравить всех ветеранов, офицеров, мичманов, служащих в РТО ЛенВМБ, с
50-летием Радиотехнического отдела, пожелать всем успехов в деле дальнейшего укрепления нашего ВМФ, успешного завершения проводимых работ, крепкого здоровья, бодрости и оптимизма.