Кафедра радиотехнических систем,  одна из старейших в училище, была  образована в 1948 году  одновременно с формированием 1-го Балтийского высшего военно-морского училища. Первым начальником кафедры был капитан 1 ранга А.Т.Ванин. Кафедра предназначена для подготовки курсантов к исполнению обязанностей вахтенного офицера на ходу подводной лодки по вопросам управления радиоэлектронными средствами, средствами связи и средствами РЭБ ПЛ.     
В настоящее время кафедра организует и осуществляет подготовку курсантов всех специальностей по шести учебным дисциплинам: «Информатика», «Электротехника и электроника», «Метрология, стандартизация и сертификация», «Материаловедение и технология композиционных материалов», «Техническая физика» и «Радиоэлектронные средства подводных лодок и их боевое использование». До своего объединения с кафедрой электротехники и электрооборудования корабля на кафедре были  три учебные дисциплины – «Основы радиоэлектроники», «Информатика»  и «РЭС корабля и их боевое использование».
Структура кафедры сложилась к началу 80-х годов под руководством кандидата военно-морских наук доцента капитана 1 ранга Л.И. Новика, когда шел процесс освоения вычислительной техники. Именно на кафедре РТС впервые в училище стали использоваться автоматизированные технические средства обучения и контроля знаний и умений курсантов, а с 1973 года в учебно-воспитательный процесс впервые были внедрены средства электронно-вычислительной техники, что положило начало компьютеризации всего процесса профессиональной подготовки офицеров-подводников. Заметную роль в этом сыграл капитан 1 ранга В.П.Агеев. Впоследствии кафедру возглавляли такие опытные педагоги, как кандидат военно-морских наук профессор капитан 1 ранга Б.П.  Жевлаков (впоследствии заместитель начальника ВВМУПП по учебной и научной работе), капитан 1 ранга В.П.Агеев, кандидат технических наук доцент капитан 1 ранга В.В.Ротин, доцент капитан 1 ранга М.И. Валицкий, заслуженный военный специалист РФ кандидат технических наук, профессор 1 ранга А.Б.Андреев.

 

С 2002 года кафедру возглавляет доктор технических наук капитан 1 ранга Э.С.Ковтуненко, а заместителем – капитан 1 ранга Ю.А.Зуев. В настоящее время педагогический коллектив кафедры на 70% укомплектован преподавателями, имеющими учёные степени и учёные звания. 80% преподавателей кафедры имеет педагогический стаж более 10 лет. Весь профессорско-преподавательский состав кафедры имеет опыт службы на подводных лодках Северного, Тихоокеанского и Черноморского флотов. На кафедре служат такие опытные педагоги, как кандидат технических наук, доцент капитан 1 ранга А.Г.Отцовский и капитаны 2 ранга И.В.Бандурин и В.Е.Налимов.
 Основным фактором успешности состояния дел на кафедре является коллектив опытных, профессионально подготовленных специалистов-преподавателей, опирающихся на лучшие традиции, заложенные предшествующим преподавателями кафедры. На кафедре продолжают плодотворно трудиться после ухода с действительной военной службы опытные педагоги-методисты капитаны 1 ранга в отставке: доктор педагогических наук, профессор член-корреспондент Международной академии высшей школы Б.П.Жевлаков; кандидат технических наук, профессор, почётный работник высшего профессионального образования В.В.Ротин;  доцент М.И. Валицкий; кандидат технических наук, доцент Ю.И.Сумин; доцент Б.А.Анисифоров и кандидат технических наук, доцент С.И.Исляев.
В структуре кафедры организованы две лаборатории: – лаборатория радиотехнических систем, начальником которой является мичман О.В.Михненок, а заведующей кабинетом электротехники – прапорщик С.А.Фесенко, и лаборатория вычислительной техники, где начальником является капитан 2 ранга Байрамов В. Л.).     
На кафедре активно ведется научная работа. Для повышения эффективности научной работы и расширения лабораторной и научно-технической базы кафедры научные исследования проводятся во взаимодействии с различными научными и учебными организациями, среди них:  ВМА им. Н.Г. Кузнецова, ВМИРЭ им. А.С. Попова, I ЦНИИ ВМФ, ЦНИИ «Морфизприбор», ГНИИ «Гидроприбор» и др.    Результатом  такого тесного научного сотрудничества явилось то, что на кафедре за последние пять лет были защищены две докторские диссертации (капитан  1 ранга Э.С. Ковтуненко по техническим наукам и профессор кафедры Б.П.Жевлаков по педагогическим наукам), и две диссертации на соискание ученой степени кандидата технических наук (капитан 1 ранга М.А.Самугин  и капитан 1 ранга А.Ю.Шаров).

 

Образовательная деятельность кафедры не отделима от привлечения к военно-научной работе курсантов, которая тесно увязана с направлениями научных исследований кафедры. Каждый учебный год в кружке ВНОК на кафедре работают от 25 до 40 курсантов. Наиболее интересные выполненные работы отражаются в рефератах, в отчётах по НИР, в рационализаторских предложениях. Особо следует отметить поучительность успеха военно-научной работы курсанта Жернакова А.Е. под руководством профессора В.В.Ротина. В 1997 году работа под девизом «Выстрел» была представлена на конкурс на лучшую студенческую научную работу по естественным, техническим и гуманитарным наукам в вузах РФ. По итогам конкурса курсант Жернаков А.Е. был награждён медалью Министерства общего и профессионального образования РФ.
В целом высокий научно-педагогический уровень профессорско-преподавательского состава кафедры РТС, позволяет эффективно решать задачи профессиональной подготовки курсантов-подводников Морского Корпуса Петра Великого.