Директивой ГК ВМФ № ДФ-5 от 9 февраля 2002 г. перед СПб ВМИ была поставлена задача с 1 сентября 2003 г. начать подготовку мичманов по новой учебно-плановой документации, которая должна соответствовать ГОС СПО второго поколения по специальностям среднего профессионального образования. Этой же директивой с 1 июля 2002 г. завершалась подготовка мичманов в школах техников при учебных отрядах. Доучивание 2 курса было возложено на ВМИ по действовавшим на тот момент учебным планам и программам. Решением начальника института школа техников разместилась в ВГ-64. Первым начальником школы техников был назначен капитан 2 ранга Сергей Анатольевич Тимонов. В данный момент он уже капитан 1 ранга и возглавляет ракетный факультет института. Адаптация ранее  существовавших учебных планов, организация разработки новых квалификационных требований и новых учебных планов и программ легла на начальника учебного отдела капитана 1 ранга В.Ф.Казакова, методиста В.И.Суровегина, начальников кафедр и циклов вновь созданной школы техников.
Подготовка курсантов по новым учебным планам и программам началась с набором 1 курса в 2003 году. Учебные планы и программы были разработаны в соответствии с Государственным образовательным стандартом среднего профессионального образования 2104 «Автоматические системы управления», со сроком обучения 2 года 10 месяцев по четырём военным специальностям: «Эксплуатация и ремонт технических средств навигации», «Эксплуатация и ремонт систем управления и стартового оборудования ракетного вооружения подводных лодок», «Эксплуатация и ремонт противолодочного торпедного и минного вооружения подводных лодок» и «Эксплуатация и ремонт противолодочного торпедного и минного вооружения надводных кораблей».
Организация учебного процесса и методика обучения в ШТ соответствует любому гражданскому техникуму. Ежегодно курсанты проходят практику на кораблях и подводных лодках различных флотов, участвуют в дальних морских походах. Окончившим ШТ присваивается воинское звание «мичман», выдается оружие (кортик) и нагрудный знак об окончании среднего специального учебного заведения.
В настоящее время ШТ командует капитан 2 ранга Василий Андреевич Карпович, заместителем по воспитательной работе – капитан 2 ранга В.В.Азаров, а помощником по учебной и строевой работе – капитан 2 ранга А.Ю.Бармин. За 5 лет со дня создания было произведено 3 выпуска мичманов общей численностью 163 человека. В настоящее время в ШТ проходят обучение 110 курсантов.